Technologie et instrument de détection par PCR numérique sur puce développés

Mise à jour : 6 août 2023
Technologie et instrument de détection par PCR numérique sur puce développés

Une équipe conjointe de Chine a récemment fourni une méthode de détection quantitative sensible, multiplexée, pour le diagnostic précoce et le traitement ciblé des néoplasmes myéloprolifératifs, un type de tumeur hématologique chronique qui s'accompagne d'une insuffisance médullaire ou d'une leucémie.

L'équipe, l'Institut de Suzhou de génie biomédical et Technologie de l'Académie chinoise des sciences et de l'hôpital Huashan, ont créé une plateforme d'amplification isotherme à boucle numérique assistée par nanoparticules (nano-dLAMP) pour l'analyse des néoplasmes myéloprolifératifs.

La réaction en chaîne par polymérase numérique (PCR numérique, dPCR), une technologie de détection d'acides nucléiques à haute sensibilité, quantitative absolue et à haute tolérance, joue un rôle important dans divers domaines d'application, tels que la détection de mutations rares, la variation du nombre de copies, la biopsie liquide , analyse unicellulaire, détection génétiquement modifiée, test de charge virale et analyse quantitative microbiologique.

Dans cette étude, les chercheurs ont fabriqué des puces à puces avec quatre partitions physiques pour la détection simultanée de la calréticuline de type 1, de la calréticuline de type 2, des mutations janus kinase 2 V617F et d'un gène de référence interne.

Ils ont ensuite utilisé des additifs PCR et des nanoparticules pour rendre l'amplification isotherme à médiation par boucle (LAMP) traditionnelle adaptée à une amplification à l'échelle du nanolitre.

Les résultats suggèrent que les nanoparticules pourraient améliorer les performances d'amplification du nanolitre LAMP.

La détection quantitative des principaux marqueurs moléculaires des néoplasmes myéloprolifératifs a pu être effectuée simultanément dans une puce microarray à quatre partitions en une heure. L'accord entre la plate-forme développée et le Quantstudio 3D commercial était élevé à 99%.

Cette plate-forme nano-dLAMP précise, rapide, multiplex et peu coûteuse pourrait être un outil prometteur pour le diagnostic clinique à l'avenir, selon les chercheurs.

Le groupe se concentre sur le domaine des biocapteurs depuis plus de 10 ans et a accumulé une base solide dans le développement de méthodes de biocapteurs, la conception et le traitement de biopuces et le développement d'instruments bioscientifiques.

Dans le cadre de la recherche et du développement de PCR numérique, une méthode dPCR sur puce (cdPCR) avec une stabilité d'isolement élevée, une bonne uniformité de température et une vitesse de détection rapide ont été développées. Une série de progrès ont été obtenus sur la méthode de détection, puce, réactif et instrument de cdPCR.

 

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